白塞氏病的西医治疗多用糖皮质激素、免疫抑制剂类药物，用药周期长，且对患者的副损伤也比较大，故有一部分患者会寻求中医药治疗，中医在治疗该病的时候常根据不同的临床分期选择适宜的药物。
1、急性活动期
证见口腔黏膜与外阴溃烂、灼痛，全身症状有低热口渴，烦躁不安，舌红苔黄，脉滑或弦数，此属湿热内聚，郁久化火之证。治疗以清心降火，除热利湿为主，用药多选导赤散。若患者发作源于情志过极，肝经火旺，则多伴肋胁胀痛，可选用具有疏肝泻火、清热凉血功效的丹栀逍遥散;高热不退，大便秘结，腹胀腹痛，血象、血沉增高明显者，多属邪热内炽之证，可选用具有清气除热，通腑泄浊功效的白虎汤合小承气汤。
2、中间恢复期
证见口腔和外阴溃疡好转，发热、便秘、腹胀、腹痛已基本消失，血象、血沉等实验室检查指标基本正常。治疗以活血化瘀，清解余邪为主，可选用复元活血汤随证加减治疗，对于热邪重者，可加用柴胡疏肝散。
3、临床缓解期
此期患者症状基本消失，实验室检查指标基本正常，治疗以提高机体免疫功能，延长缓解期与减少复发为主，可选用十全大补丸、左归丸、右归丸、金匮肾气丸等巩固治疗。